پروتوزوئرها و سایر حیوانات:

تفاوت حیوانات میکروسکوپی با گیاهان میکروسکوپی در توانایی آنها برای متابولیز مستقیم ذرات جامد است.

 پروتوزوئرها و حیوانات بزرگتر در واقع مواد آلی جامد را در داخل بدن خود بیشتر از محیط خارجی هیدرولیز می کنند. حیوانات دارای سیستم های متابولیکی پیچیده ای هستند که به آنها اجازه می دهد تا مواد مغذی را متابولیز نموده و مقداری از جامدات آلی معلق بی اثر را رها کرده و به محیط برگردانند.

حیوانات میکروسکوپی از ارگانیسم های تک سلولی تا حیوانات چند سلولی هستند که اندازه آنها نزدیک اندازه ماکروسکوپی ها می باشند. حیوانات میکروسکوپی بخشی از مواد آلی هستند که یک حلقه را در زنجیره غذایی برای برای ارگانیسم های ماکروسکوپی تشکیل می دهند.