ساده ترین حیوانات میکروسکوپی و ارگانیسم هایی تک سلولی هستند. در طبیعت، باکتری ها منبع غذایی اصلی برای پروتوزوئرها را تشکیل می دهند. باکتری ها انواع مواد مغذی را در داخل پروتوپلاسم خود متراکم کرده و برای پروتوزوئرها غذای خوبی را می سازند. قسمت مواد آلی باکتری ها برای گرفتن انرژی به منظور سنتز پروتوپلاسم جدید از مواد آلی باقیمانده، اکسید می شود. اکثر پروتوزوئرها هوازی هستند و به اکسیژن محلول به عنوان پذیرنده الکترونی خود نیاز دارند. پروتوزوئرهای بیهوازی به تعداد کم تری وجود دارند. مشکل پروتوزوئرهای بیهوازی بسیار حادتر از باکتری های بیهوازی است.

ارگانیسم های بیهوازی باید مقادیر بسیار زیادی مواد آلی را برای تامین انرژی بگیرند، به دلیل اینکه قسمتی از انرژی در مواد متابولیز شده، باقی می ماند. پروتوزوئرهای بیهوازی، تنها در محیط هایی یافت میشوند که دارای مقادیر زیادی مواد آلی و مقادیر زیادی باکتری می باشند.

پروتوزوئرها از روی خصوصیات فیزیکی شان کاملا مشخص هستند. پروتوزوئرها بزرگتر از باکتری ها هستند و اندازه آنها از تقریبا 100 میکرون تا چند صد میکرون است. چون پروتوزوئرها دارای یک هسته مشخص هستند، بنابراین آنها را تحت عنوان یوکاریوت ها طبقه بندی نمودند.